Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms