Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIL3Q16649 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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NFIL3Q16649 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIL3Q16649 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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