Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.676e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.726e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EVA1A-210ENST00000486696 585 ntTSL 35.88□□□□□ -1.476e-6■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 220.53■□□□□ 0.884e-7■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 26.93□□□□□ -1.36e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.335e-8■■■□□ 17.8
SRSF7Q16629 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-9■■■□□ 17.7
SRSF7Q16629 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.022e-9■■■□□ 17.7
SRSF7Q16629 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.074e-12■■■□□ 17.7
SRSF7Q16629 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.027e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 519.75■□□□□ 0.757e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 218.96■□□□□ 0.637e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 317.66■□□□□ 0.427e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.186e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.166e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 516.04■□□□□ 0.167e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.067e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 06e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-228ENST00000639388 2514 ntTSL 514.86□□□□□ -0.036e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-236ENST00000640358 2313 ntTSL 514.27□□□□□ -0.126e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.136e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.146e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-216ENST00000638468 1788 ntTSL 513.54□□□□□ -0.246e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-244ENST00000640792 2452 ntTSL 513.27□□□□□ -0.296e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.296e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-227ENST00000639365 1584 ntTSL 512.64□□□□□ -0.396e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-225ENST00000639199 2137 ntTSL 512.41□□□□□ -0.426e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-247ENST00000640871 1045 ntTSL 511.9□□□□□ -0.56e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 511.74□□□□□ -0.537e-7■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.626e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-214ENST00000638219 1425 ntTSL 511.09□□□□□ -0.636e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-212ENST00000638189 1945 ntTSL 511.03□□□□□ -0.646e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.656e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-246ENST00000640866 1973 ntTSL 510.23□□□□□ -0.776e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-219ENST00000638697 1705 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.876e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-239ENST00000640608 3871 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.886e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-237ENST00000640443 3929 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.886e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 AC005670.2-202ENST00000639822 1564 ntTSL 59.25□□□□□ -0.936e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-218ENST00000638634 3446 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.946e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.976e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 38.89□□□□□ -0.996e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-207ENST00000572403 648 ntTSL 58.84□□□□□ -0.996e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-223ENST00000639066 1180 ntTSL 58.83□□□□□ -16e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-213ENST00000638216 3574 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.016e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-242ENST00000640711 1083 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.026e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-217ENST00000638579 1273 ntTSL 58.66□□□□□ -1.026e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 OSBPL2-211ENST00000622332 754 ntTSL 37.93□□□□□ -1.146e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.166e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-230ENST00000639985 1618 ntTSL 57.73□□□□□ -1.176e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-234ENST00000640138 3408 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.186e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-220ENST00000638838 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.226e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-243ENST00000640723 941 ntTSL 57.16□□□□□ -1.266e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.296e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.316e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-229ENST00000639713 622 ntTSL 56.86□□□□□ -1.316e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.466e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.726e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.856e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.076e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 MYSM1-207ENST00000493821 7793 ntTSL 1 (best)1.96□□□□□ -2.16e-10■■■□□ 17.6
SRSF7Q16629 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.763e-13■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.365e-6■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.415e-6■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 512.08□□□□□ -0.485e-6■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.515e-6■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-6■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.035e-6■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 58.64□□□□□ -1.035e-6■■■□□ 17.5
SRSF7Q16629 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.122e-7■■■□□ 17.4
SRSF7Q16629 SLC26A6-214ENST00000462009 825 ntTSL 315.75■□□□□ 0.114e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 212.35□□□□□ -0.434e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.494e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-201ENST00000307364 2586 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.614e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.654e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.694e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 36.94□□□□□ -1.34e-7■■■□□ 17.3
SRSF7Q16629 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HDAC6-218ENST00000470942 668 ntTSL 312.33□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HDAC6-236ENST00000498808 566 ntTSL 512.11□□□□□ -0.471e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HDAC6-229ENST00000486665 598 ntTSL 210.48□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 29.12□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HDAC6-223ENST00000480525 412 ntTSL 34.21□□□□□ -1.741e-6■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-8■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-8■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HAGLR-201ENST00000413969 545 ntTSL 313.46□□□□□ -0.253e-8■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 HAGLR-203ENST00000417086 984 ntTSL 212.32□□□□□ -0.443e-8■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 314.33□□□□□ -0.122e-7■■■□□ 17.2
SRSF7Q16629 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 39.56□□□□□ -0.882e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 59.48□□□□□ -0.892e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 29.35□□□□□ -0.912e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 59.3□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 17.1
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