Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA6Q16445 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRA6Q16445 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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