Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIP4Q15650 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP4Q15650 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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