Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIV2LQ15477 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms