Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3CQ15386 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms