Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF6Q15052 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF6Q15052 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF6Q15052 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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