Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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SETDB1Q15047 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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SETDB1Q15047 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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SETDB1Q15047 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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SETDB1Q15047 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETDB1Q15047 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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SETDB1Q15047 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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SETDB1Q15047 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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SETDB1Q15047 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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