Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNIP1Q15025 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNIP1Q15025 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNIP1Q15025 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms