Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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