Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NID2Q14112 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NID2Q14112 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NID2Q14112 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NID2Q14112 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NID2Q14112 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NID2Q14112 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NID2Q14112 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NID2Q14112 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NID2Q14112 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NID2Q14112 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NID2Q14112 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NID2Q14112 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NID2Q14112 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NID2Q14112 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NID2Q14112 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NID2Q14112 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NID2Q14112 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NID2Q14112 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NID2Q14112 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NID2Q14112 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NID2Q14112 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NID2Q14112 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NID2Q14112 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NID2Q14112 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NID2Q14112 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NID2Q14112 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NID2Q14112 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NID2Q14112 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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NID2Q14112 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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NID2Q14112 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NID2Q14112 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NID2Q14112 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NID2Q14112 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NID2Q14112 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NID2Q14112 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NID2Q14112 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NID2Q14112 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NID2Q14112 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NID2Q14112 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NID2Q14112 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NID2Q14112 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NID2Q14112 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NID2Q14112 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NID2Q14112 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NID2Q14112 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NID2Q14112 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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