Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMQ13315 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMQ13315 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMQ13315 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMQ13315 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMQ13315 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMQ13315 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATMQ13315 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATMQ13315 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMQ13315 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMQ13315 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMQ13315 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMQ13315 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATMQ13315 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMQ13315 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMQ13315 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMQ13315 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMQ13315 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMQ13315 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATMQ13315 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATMQ13315 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMQ13315 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMQ13315 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMQ13315 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATMQ13315 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATMQ13315 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATMQ13315 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATMQ13315 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATMQ13315 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATMQ13315 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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