Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K1Q13233 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.38
MAP3K1Q13233 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MAP3K1Q13233 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K1Q13233 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
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