Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF1Q13077 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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