Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP1Q12981 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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