Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNMA1Q12791 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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