Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 SPS2YDR522C 1509 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 TFC6YDR362C 2019 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 RDI1YDL135C 609 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YER084W-AYER084W-A 513 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 TAD2YJL035C 753 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 MRT4YKL009W 711 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YLR312CYLR312C 1197 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 MVD1YNR043W 1191 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 LIP5YOR196C 1245 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 POX1YGL205W 2247 nt7.88□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 CRF1YDR223W 1404 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 COQ6YGR255C 1440 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 PST1YDR055W 1335 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 PPH3YDR075W 927 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 RPC17YJL011C 486 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 THI11YJR156C 1023 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 PRS1YKL181W 1284 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 PRM9YAR031W 897 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 MAP1YLR244C 1164 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 MID2YLR332W 1131 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YLR339CYLR339C 552 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 ARG1YOL058W 1263 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 SCO1YBR037C 888 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 ATR1YML116W 1629 nt7.87□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 SET4YJL105W 1683 nt7.86□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 CAK1YFL029C 1107 nt7.86□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt7.86□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 CHS7YHR142W 951 nt7.86□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YHR180WYHR180W 492 nt7.86□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 CCS1YMR038C 750 nt7.86□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 GPI12YMR281W 915 nt7.86□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 SMC5YOL034W 3282 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YCR085WYCR085W 354 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YGR111WYGR111W 1203 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 RPP1YHR062C 882 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 RPS31YLR167W 459 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YAR053WYAR053W 297 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 AAD14YNL331C 1131 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 HSH49YOR319W 642 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 SPC29YPL124W 762 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 ALG14YBR070C 714 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 FKH1YIL131C 1455 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 AI4Q0065 1671 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 HXT13YEL069C 1695 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 MUP3YHL036W 1641 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 WSC4YHL028W 1818 nt7.85□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 SPO23YBR250W 1572 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 HEL1YKR017C 1656 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 INO2YDR123C 915 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YDR157WYDR157W 402 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 MED6YHR058C 888 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YKL162CYKL162C 1209 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 MET22YOL064C 1074 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 ITR1YDR497C 1755 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 ART10YLR392C 1557 nt7.84□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 DEF1YKL054C 2217 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 PRS2YER099C 957 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 NSA2YER126C 786 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 AUR1YKL004W 1206 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 NFU1YKL040C 771 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YAR030CYAR030C 342 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 GCD7YLR291C 1146 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 RAD10YML095C 633 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 ATO2YNR002C 849 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 PET123YOR158W 957 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 GET4YOR164C 939 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YCL007CYCL007C 393 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YCR061WYCR061W 1896 nt7.83□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 PDE1YGL248W 1110 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 RPL27AYHR010W 411 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 BUD19YJL188C 309 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 TUM1YOR251C 915 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 ASR1YPR093C 867 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YPR172WYPR172W 603 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 BSD2YBR290W 966 nt7.82□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 DAN1YJR150C 897 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 RIF2YLR453C 1188 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YOR114WYOR114W 885 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 PNO1YOR145C 825 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 YPR130CYPR130C 408 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 MRP2YPR166C 348 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 MGA1YGR249W 1371 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 ELP4YPL101W 1371 nt7.81□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 HSV2YGR223C 1347 nt7.8□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 PDC6YGR087C 1692 nt7.8□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 PRR2YDL214C 2100 nt7.8□□□□□ -1.16
TFB4Q12004 MIX14YDR031W 366 nt7.8□□□□□ -1.16
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