Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 POR1YNL055C 852 nt5.75□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 YOR024WYOR024W 324 nt5.75□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 STE13YOR219C 2796 nt5.75□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 YDR396WYDR396W 501 nt5.74□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 YHR145CYHR145C 357 nt5.74□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 HSP150YJL159W 1242 nt5.74□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 SIR2YDL042C 1689 nt5.74□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 TUB2YFL037W 1374 nt5.73□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 SCM3YDL139C 672 nt5.73□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 MPM1YJL066C 759 nt5.73□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 YJL107CYJL107C 1164 nt5.73□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 JEM1YJL073W 1938 nt5.73□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 TAH18YPR048W 1872 nt5.73□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 KTI12YKL110C 942 nt5.72□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 YKR041WYKR041W 753 nt5.72□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 YNL108CYNL108C 813 nt5.72□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 YNR068CYNR068C 819 nt5.72□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 TOM5YPR133W-A 153 nt5.72□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 TNA1YGR260W 1605 nt5.72□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 RFA1YAR007C 1866 nt5.72□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 ECM3YOR092W 1842 nt5.71□□□□□ -1.49
DSE3Q08729 CCZ1YBR131W 2115 nt5.71□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YIL067CYIL067C 2037 nt5.71□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 VCX1YDL128W 1236 nt5.71□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YDR053WYDR053W 396 nt5.71□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.71□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 BZZ1YHR114W 1902 nt5.71□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 VBA1YMR088C 1689 nt5.71□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 FLC3YGL139W 2409 nt5.7□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 PIC2YER053C 903 nt5.7□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 MRS3YJL133W 945 nt5.7□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 SFB3YHR098C 2790 nt5.69□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 TFC6YDR362C 2019 nt5.69□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 EIS1YMR031C 2532 nt5.69□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 FAU1YER183C 636 nt5.69□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 NCS6YGL211W 1080 nt5.69□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.69□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 MTW1YAL034W-A 870 nt5.69□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 RSM23YGL129C 1353 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 RNR3YIL066C 2610 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 COS6YGR295C 1146 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 NIT2YJL126W 924 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 APN1YKL114C 1104 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YNL296WYNL296W 315 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 NAT5YOR253W 531 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 CAM1YPL048W 1248 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 ADE4YMR300C 1533 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 UTP9YHR196W 1728 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 GSY2YLR258W 2118 nt5.68□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 THP1YOL072W 1368 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 RPB4YJL140W 666 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YKL223WYKL223W 333 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 SKG1YKR100C 1068 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 SCW10YMR305C 1170 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YNR042WYNR042W 429 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 CKB2YOR039W 777 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 SUE1YPR151C 621 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 RBA50YDR527W 1320 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 PRR1YKL116C 1557 nt5.67□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 RIM101YHL027W 1878 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 NOP2YNL061W 1857 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 PUS6YGR169C 1215 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 NSG1YHR133C 876 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 MRPL4YLR439W 960 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 RPL3YOR063W 1164 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YPR150WYPR150W 522 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 ZUO1YGR285C 1302 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 OPT1YJL212C 2400 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 VHS1YDR247W 1386 nt5.66□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 FOB1YDR110W 1701 nt5.65□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 DAK1YML070W 1755 nt5.65□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 FUN19YAL034C 1242 nt5.65□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 ATG33YLR356W 594 nt5.65□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 SEC17YBL050W 879 nt5.65□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 YBL081WYBL081W 1107 nt5.65□□□□□ -1.5
DSE3Q08729 BPL1YDL141W 2073 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 PDC1YLR044C 1692 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 CTS1YLR286C 1689 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 OST3YOR085W 1053 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 ISU2YOR226C 471 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 PDB1YBR221C 1101 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 PCL10YGL134W 1302 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 OXP1YKL215C 3861 nt5.64□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 VPS1YKR001C 2115 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 IWR1YDL115C 1062 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 JAC1YGL018C 555 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 YGL118CYGL118C 438 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 VAM7YGL212W 951 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 RHO3YIL118W 696 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 ECM15YBL001C 315 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 YMR010WYMR010W 1218 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 AIM41YOR215C 558 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 CPA1YOR303W 1236 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 HOS1YPR068C 1413 nt5.63□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 SIT1YEL065W 1887 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 FUI1YBL042C 1920 nt5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms