Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSTF1Q05048 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSTF1Q05048 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF1Q05048 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms