Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 ISR1YPR106W 1332 nt6.17□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 IMA5YJL216C 1746 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 BUD14YAR014C 2130 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 ATO3YDR384C 828 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 CIS3YJL158C 684 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 YJU3YKL094W 942 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 TAL1YLR354C 1008 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 YML6YML025C 861 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 YBL029WYBL029W 1131 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 YOR289WYOR289W 756 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 RPN7YPR108W 1290 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 snR3snR3 194 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 NTH2YBR001C 2343 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 VHS1YDR247W 1386 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 ERC1YHR032W 1746 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 SPO77YLR341W 1434 nt6.16□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 PCL8YPL219W 1479 nt6.15□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 HAS1YMR290C 1518 nt6.15□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.15□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 YDL121CYDL121C 450 nt6.15□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 MAD2YJL030W 591 nt6.15□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 SSP120YLR250W 705 nt6.15□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 snR32snR32 188 nt6.15□□□□□ -1.42
CEF1Q03654 MCM6YGL201C 3054 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YCL065WYCL065W 369 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 SYF2YGR129W 648 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 DJP1YIR004W 1299 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 ARG8YOL140W 1272 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YPR109WYPR109W 885 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 DXO1YDR370C 1329 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 NGL2YMR285C 1548 nt6.14□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 ACS2YLR153C 2052 nt6.13□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YRA1YDR381W 681 nt6.13□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 CAD1YDR423C 1230 nt6.13□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 CAB4YGR277C 918 nt6.13□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 RRP4YHR069C 1080 nt6.13□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YKR075CYKR075C 924 nt6.13□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YDR514CYDR514C 1452 nt6.13□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 ACC1YNR016C 6702 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 MTF2YDL044C 1323 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 COX9YDL067C 180 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 MDH3YDL078C 1032 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YDL172CYDL172C 480 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 GLE2YER107C 1098 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 CLD1YGR110W 1338 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 MAL11YGR289C 1851 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 PHO86YJL117W 936 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YKL031WYKL031W 414 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 DBR1YKL149C 1218 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 SPC24YMR117C 642 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 SMA1YPL027W 738 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 MLC2YPR188C 492 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 ARR1YPR199C 885 nt6.12□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 ARN2YHL047C 1863 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 IBA57YJR122W 1494 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 DIA3YDL024C 1407 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 OXP1YKL215C 3861 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 RPS2YGL123W 765 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 SUA5YGL169W 1281 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 CBP4YGR174C 513 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 NTR2YKR022C 969 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 TAX4YJL083W 1815 nt6.11□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 RKM4YDR257C 1485 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 KCH1YJR054W 1494 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 IFM1YOL023W 2031 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 VPS4YPR173C 1314 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YDL114WYDL114W 927 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YDL119CYDL119C 924 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YDR154CYDR154C 351 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 SEC20YDR498C 1152 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 RPL7AYGL076C 735 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 MPC1YGL080W 393 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 KSS1YGR040W 1107 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 APS3YJL024C 585 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 CSL4YNL232W 879 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 RPL7BYPL198W 735 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 snR34snR34 203 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 PWP1YLR196W 1731 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 TUP1YCR084C 2142 nt6.1□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 INO2YDR123C 915 nt6.09□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.09□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 PAN6YIL145C 930 nt6.09□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 NPA3YJR072C 1158 nt6.09□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 HSP78YDR258C 2436 nt6.09□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 AMD1YML035C 2433 nt6.09□□□□□ -1.43
CEF1Q03654 PPM1YDR435C 987 nt6.08□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 GRE3YHR104W 984 nt6.08□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 LST8YNL006W 912 nt6.08□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 VMA4YOR332W 702 nt6.08□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 VPS5YOR069W 2028 nt6.08□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 MCM4YPR019W 2802 nt6.07□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 DON1YDR273W 1098 nt6.07□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 RPL10YLR075W 666 nt6.07□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 UIP3YAR027W 708 nt6.07□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 MRPL22YNL177C 930 nt6.07□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 CDC19YAL038W 1503 nt6.07□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 PRP46YPL151C 1356 nt6.06□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 STB5YHR178W 2232 nt6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms