Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ID3Q02535 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ID3Q02535 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ID3Q02535 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ID3Q02535 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ID3Q02535 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ID3Q02535 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ID3Q02535 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ID3Q02535 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ID3Q02535 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ID3Q02535 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ID3Q02535 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ID3Q02535 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ID3Q02535 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ID3Q02535 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ID3Q02535 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ID3Q02535 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ID3Q02535 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ID3Q02535 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ID3Q02535 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ID3Q02535 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ID3Q02535 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ID3Q02535 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ID3Q02535 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ID3Q02535 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms