Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFAP4Q01664 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TFAP4Q01664 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms