Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC42EP1Q00587 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms