Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK6Q00534 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms