Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD1P62314 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPD1P62314 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms