Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBE2HP62256 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE2HP62256 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms