Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMFBP60983 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMFBP60983 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMFBP60983 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMFBP60983 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GMFBP60983 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMFBP60983 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GMFBP60983 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GMFBP60983 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMFBP60983 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMFBP60983 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMFBP60983 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMFBP60983 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMFBP60983 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMFBP60983 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMFBP60983 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMFBP60983 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMFBP60983 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMFBP60983 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMFBP60983 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMFBP60983 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMFBP60983 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMFBP60983 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms