Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CABP4P57796 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CABP4P57796 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CABP4P57796 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CABP4P57796 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CABP4P57796 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CABP4P57796 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CABP4P57796 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CABP4P57796 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CABP4P57796 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CABP4P57796 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CABP4P57796 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CABP4P57796 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CABP4P57796 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CABP4P57796 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CABP4P57796 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CABP4P57796 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CABP4P57796 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CABP4P57796 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CABP4P57796 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CABP4P57796 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CABP4P57796 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CABP4P57796 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CABP4P57796 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CABP4P57796 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CABP4P57796 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CABP4P57796 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CABP4P57796 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CABP4P57796 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CABP4P57796 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CABP4P57796 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CABP4P57796 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CABP4P57796 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CABP4P57796 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CABP4P57796 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CABP4P57796 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CABP4P57796 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CABP4P57796 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CABP4P57796 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CABP4P57796 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CABP4P57796 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CABP4P57796 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CABP4P57796 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CABP4P57796 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CABP4P57796 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CABP4P57796 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CABP4P57796 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CABP4P57796 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CABP4P57796 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CABP4P57796 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CABP4P57796 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CABP4P57796 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CABP4P57796 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CABP4P57796 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CABP4P57796 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CABP4P57796 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CABP4P57796 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CABP4P57796 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CABP4P57796 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CABP4P57796 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CABP4P57796 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CABP4P57796 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CABP4P57796 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CABP4P57796 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CABP4P57796 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CABP4P57796 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms