Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN8P56748 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms