Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP1P56715 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP1P56715 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP1P56715 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP1P56715 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP1P56715 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP1P56715 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP1P56715 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP1P56715 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP1P56715 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP1P56715 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RP1P56715 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP1P56715 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP1P56715 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP1P56715 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP1P56715 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP1P56715 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RP1P56715 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP1P56715 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP1P56715 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP1P56715 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP1P56715 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP1P56715 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP1P56715 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP1P56715 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP1P56715 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP1P56715 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP1P56715 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP1P56715 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP1P56715 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP1P56715 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP1P56715 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP1P56715 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP1P56715 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP1P56715 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RP1P56715 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RP1P56715 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RP1P56715 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP1P56715 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP1P56715 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP1P56715 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP1P56715 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP1P56715 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP1P56715 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms