Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTBP2P56545 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTBP2P56545 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTBP2P56545 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTBP2P56545 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CTBP2P56545 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTBP2P56545 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTBP2P56545 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTBP2P56545 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTBP2P56545 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms