Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA1P56199 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA1P56199 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms