Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX9P55771 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX9P55771 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX9P55771 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX9P55771 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX9P55771 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX9P55771 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX9P55771 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX9P55771 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX9P55771 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX9P55771 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX9P55771 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX9P55771 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX9P55771 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX9P55771 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX9P55771 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX9P55771 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX9P55771 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX9P55771 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms