Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF1P55201 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF1P55201 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF1P55201 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms