Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYS2P54840 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYS2P54840 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYS2P54840 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYS2P54840 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYS2P54840 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYS2P54840 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GYS2P54840 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GYS2P54840 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYS2P54840 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYS2P54840 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYS2P54840 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYS2P54840 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GYS2P54840 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GYS2P54840 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GYS2P54840 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GYS2P54840 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GYS2P54840 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GYS2P54840 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GYS2P54840 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GYS2P54840 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GYS2P54840 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms