Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATN1P54259 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATN1P54259 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATN1P54259 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATN1P54259 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATN1P54259 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATN1P54259 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATN1P54259 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATN1P54259 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATN1P54259 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATN1P54259 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATN1P54259 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATN1P54259 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATN1P54259 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATN1P54259 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATN1P54259 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATN1P54259 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATN1P54259 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATN1P54259 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATN1P54259 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATN1P54259 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATN1P54259 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATN1P54259 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATN1P54259 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATN1P54259 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATN1P54259 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATN1P54259 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATN1P54259 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATN1P54259 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATN1P54259 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATN1P54259 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATN1P54259 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATN1P54259 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATN1P54259 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATN1P54259 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATN1P54259 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATN1P54259 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATN1P54259 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATN1P54259 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATN1P54259 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATN1P54259 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATN1P54259 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATN1P54259 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATN1P54259 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATN1P54259 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATN1P54259 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATN1P54259 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATN1P54259 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATN1P54259 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATN1P54259 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATN1P54259 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATN1P54259 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATN1P54259 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATN1P54259 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms