Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP1P53384 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP1P53384 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms