Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA3P52797 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms