Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK4P51957 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK4P51957 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK4P51957 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK4P51957 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK4P51957 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK4P51957 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK4P51957 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK4P51957 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK4P51957 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK4P51957 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK4P51957 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEK4P51957 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK4P51957 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK4P51957 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK4P51957 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK4P51957 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK4P51957 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK4P51957 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK4P51957 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK4P51957 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK4P51957 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK4P51957 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK4P51957 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK4P51957 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK4P51957 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK4P51957 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK4P51957 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK4P51957 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK4P51957 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK4P51957 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK4P51957 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK4P51957 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEK4P51957 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEK4P51957 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEK4P51957 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEK4P51957 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEK4P51957 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEK4P51957 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms