Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLCNKBP51801 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCNKBP51801 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms