Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A2P50993 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A2P50993 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms