Protein–RNA interactions for Protein: P50079

HSV2, SVP1-like protein 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSV2P50079 YDL177CYDL177C 513 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 HVG1YER039C 750 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 RPN11YFR004W 921 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 SNL1YIL016W 480 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 YLR049CYLR049C 1287 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 TIS11YLR136C 858 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 ATG29YPL166W 642 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 ADY3YDL239C 2373 nt5.9□□□□□ -1.46
HSV2P50079 SKY1YMR216C 2229 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 ALT1YLR089C 1779 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 DOS2YDR068W 933 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YDR124WYDR124W 975 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YDR396WYDR396W 501 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YKL077WYKL077W 1179 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RPL31BYLR406C 342 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RAD10YML095C 633 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 TMA46YOR091W 1038 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 SMK1YPR054W 1167 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 SAS10YDL153C 1833 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PEX3YDR329C 1326 nt5.89□□□□□ -1.47
HSV2P50079 GSH1YJL101C 2037 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 SLA2YNL243W 2907 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 UBC1YDR177W 648 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RRP17YDR412W 708 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 HYM1YKL189W 1200 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 NTR2YKR022C 969 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 SWD1YAR003W 1281 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 HEK2YBL032W 1146 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YNR014WYNR014W 639 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 NOT3YIL038C 2511 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 HXT4YHR092C 1731 nt5.88□□□□□ -1.47
HSV2P50079 GPH1YPR160W 2709 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PPH22YDL188C 1134 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 NUP42YDR192C 1293 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 BGL2YGR282C 942 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PAN5YHR063C 1140 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 EBP2YKL172W 1284 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 GCN3YKR026C 918 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 COS3YML132W 1140 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 BTS1YPL069C 1008 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 BBP1YPL255W 1158 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 COS2YBR302C 1140 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 AFG1YEL052W 1530 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RSP5YER125W 2430 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PMA1YGL008C 2757 nt5.87□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RAP1YNL216W 2484 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PUS9YDL036C 1389 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YDL119CYDL119C 924 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 ENT5YDR153C 1236 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 BUD16YEL029C 939 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YGR219WYGR219W 342 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 AIR1YIL079C 1083 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RPC17YJL011C 486 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RPF2YKR081C 1035 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 GRX1YCL035C 333 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RGD2YFL047W 2145 nt5.86□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PRP9YDL030W 1593 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 ASA1YPR085C 1332 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 COS7YDL248W 1152 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YDR187CYDR187C 519 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YDR290WYDR290W 330 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 RPB7YDR404C 516 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 CBR1YIL043C 855 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YRB2YIL063C 984 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 AIM23YJL131C 1071 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 COS5YJR161C 1152 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YKL102CYKL102C 306 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 ECM1YAL059W 639 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 NIT3YLR351C 876 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 SCS7YMR272C 1155 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YNL226WYNL226W 411 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 SEC62YPL094C 825 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PTC4YBR125C 1182 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 ATG14YBR128C 1035 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 SRB6YBR253W 366 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 TKL1YPR074C 2043 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 NUD1YOR373W 2556 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 BDP1YNL039W 1785 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 ALG9YNL219C 1668 nt5.85□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YDR444WYDR444W 2064 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YHR020WYHR020W 2067 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 TMN2YDR107C 2019 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YMD8YML038C 1329 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 GEX1YCL073C 1848 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 HED1YDR014W-A 489 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 KEG1YFR042W 603 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 CUP2YGL166W 678 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YOL162WYOL162W 648 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 NAT3YPR131C 588 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 BSD2YBR290W 966 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 YMR1YJR110W 2067 nt5.84□□□□□ -1.47
HSV2P50079 PPM2YOL141W 2088 nt5.83□□□□□ -1.48
HSV2P50079 MRPL1YDR116C 858 nt5.83□□□□□ -1.48
HSV2P50079 RML2YEL050C 1182 nt5.83□□□□□ -1.48
HSV2P50079 YGR015CYGR015C 987 nt5.83□□□□□ -1.48
HSV2P50079 RME1YGR044C 903 nt5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.2 ms