Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC34P49427 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC34P49427 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC34P49427 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC34P49427 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC34P49427 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC34P49427 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC34P49427 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC34P49427 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC34P49427 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC34P49427 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC34P49427 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDC34P49427 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDC34P49427 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC34P49427 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC34P49427 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC34P49427 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC34P49427 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms