Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKI67P46013 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKI67P46013 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKI67P46013 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKI67P46013 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKI67P46013 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKI67P46013 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKI67P46013 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKI67P46013 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKI67P46013 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKI67P46013 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKI67P46013 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKI67P46013 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKI67P46013 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKI67P46013 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKI67P46013 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKI67P46013 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKI67P46013 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MKI67P46013 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKI67P46013 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKI67P46013 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKI67P46013 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKI67P46013 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MKI67P46013 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKI67P46013 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKI67P46013 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKI67P46013 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKI67P46013 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MKI67P46013 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MKI67P46013 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKI67P46013 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKI67P46013 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKI67P46013 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKI67P46013 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKI67P46013 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKI67P46013 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MKI67P46013 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKI67P46013 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKI67P46013 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MKI67P46013 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKI67P46013 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKI67P46013 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKI67P46013 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKI67P46013 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKI67P46013 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKI67P46013 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKI67P46013 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKI67P46013 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKI67P46013 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MKI67P46013 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MKI67P46013 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms