Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYKP43405 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYKP43405 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYKP43405 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYKP43405 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYKP43405 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYKP43405 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYKP43405 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYKP43405 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYKP43405 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYKP43405 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYKP43405 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYKP43405 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYKP43405 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYKP43405 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYKP43405 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYKP43405 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYKP43405 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYKP43405 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYKP43405 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYKP43405 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYKP43405 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYKP43405 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYKP43405 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYKP43405 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYKP43405 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYKP43405 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYKP43405 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYKP43405 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYKP43405 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYKP43405 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYKP43405 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYKP43405 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYKP43405 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYKP43405 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYKP43405 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYKP43405 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYKP43405 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYKP43405 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYKP43405 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYKP43405 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYKP43405 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYKP43405 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYKP43405 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYKP43405 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYKP43405 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYKP43405 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms