Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5CP41229 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM5CP41229 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5CP41229 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms