Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPHP41219 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPHP41219 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPHP41219 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPHP41219 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPHP41219 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPHP41219 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPHP41219 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPHP41219 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPHP41219 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPHP41219 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPHP41219 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPHP41219 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPHP41219 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPHP41219 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPHP41219 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPHP41219 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPHP41219 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPHP41219 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPHP41219 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPHP41219 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPHP41219 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPHP41219 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPHP41219 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPHP41219 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPHP41219 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPHP41219 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPHP41219 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPHP41219 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPHP41219 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPHP41219 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPHP41219 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPHP41219 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPHP41219 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPHP41219 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPHP41219 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPHP41219 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPHP41219 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPHP41219 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPHP41219 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPHP41219 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPHP41219 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPHP41219 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPHP41219 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPHP41219 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPHP41219 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPHP41219 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPHP41219 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPHP41219 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPHP41219 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPHP41219 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPHP41219 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPHP41219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPHP41219 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPHP41219 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPHP41219 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPHP41219 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPHP41219 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPHP41219 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPHP41219 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPHP41219 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPHP41219 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPHP41219 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPHP41219 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPHP41219 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPHP41219 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms