Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH1P40925 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH1P40925 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH1P40925 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDH1P40925 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH1P40925 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH1P40925 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH1P40925 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH1P40925 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH1P40925 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH1P40925 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH1P40925 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDH1P40925 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH1P40925 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH1P40925 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH1P40925 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH1P40925 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH1P40925 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDH1P40925 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MDH1P40925 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDH1P40925 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDH1P40925 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MDH1P40925 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDH1P40925 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDH1P40925 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDH1P40925 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDH1P40925 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDH1P40925 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDH1P40925 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDH1P40925 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH1P40925 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDH1P40925 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH1P40925 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH1P40925 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms