Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms