Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE6BP35913 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6BP35913 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6BP35913 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6BP35913 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms